Los DIAP regionales tienen su sede en cada una de las cuatro procuradorías generales regionales (Coimbra, Évora, Lisboa y Porto).

Es responsable de dirigir la investigación y enjuiciar casos criminales violentos, económico-financieros, altamente organizados o particularmente complejos cuando la actividad criminal ocurre en regiones del área territorial de la Procuradoría General Regional respectiva, y, antes de la orden del Procurador General Regional por delitos de grave gravedad, complejidad o dispersión territorial de la actividad delictiva (artículos 70.1, 71, Estatuto del Ministerio Público/EMP).

Los DIAP regionales son dirigidos por procuradores generales adjuntos. En los DIAP regionales ejercen funciones procuradores generales adjuntos e procuradores de la República. El director del DIAP regional puede, al mismo tiempo, desempeñar las funciones ejecutivas del DIAP de la comarca en el que se encuentra, de manera agregada (artículo 70.2.3, EMP).

Los DIAP regionales pueden dividirse en unidades desconcentradas y organizarse en secciones de competencia genérica o especializada. Equipos de investigación y unidades de misión también pueden establecerse para articular segmentos específicos de la actividad del departamento (artículo 70.4.5, EMP).